O show começa apresentando jovens amigos com uma camaradagem poderosa e próxima Syaoran, um jovem arqueólogo que está investigando uma ruína dentro de Sakura, e o Reino de Clow, princesa do Reino de Clow e filha do falecido rei Clow Reed. Quando Sakura e Syaoran nas ruínas visitam, seu espírito assume o tipo de um par de asas que são fantasmagóricas que se desintegram em outras medidas. Syaoran satisfaz a Bruxa Dimensional, Yuko Ichihara, a quem ele implora por ajuda para conservar Sakura enquanto ela desce para um estado de quase morte catatônico. Yuko pode ser visto por dois outros que cada um tem seu desejo particular: Kurogane, um ninja que quer voltar para o mundo de sua casa depois de ser banido de seu mundo pela princesa Tomoyo para permitir que ele entenda o que é o verdadeiro poder; e Fai D. Flowright, um mago que quer nunca mais voltar ao mundo de sua casa, Celes, para prevenir seu rei, Ashura- ?. Na troca pelo poder de passar pelas medidas, Yuko precisa que cada um gaste com o que mais valoriza: sua espada Ginry é oferecida por Kurogane ?; Fai e Syaoran oferecem a tatuagem que suprime sua tremenda força e energia mágica e todas as lembranças de Sakura que o chamam, respectivamente. Yuko então fornece um animal chamado Mokona Modoki que envia a equipe em uma jornada através das medições em busca das penas de Sakura até eles. Depois de obter as penas primárias, Sakura começa a recuperar suas memórias e desperta de seu estado catatônico. Durante suas experiências, o grupo lentamente se aproxima do nível em que são rotulados de brincadeira por Fai como parentes. Enquanto viajam, eles descobrem que as penas concederão vários poderes não naturais àqueles que as possuem e têm suas próprias capacidades únicas.
Ao longo de sua viagem em Tóquio, a equipe descobre que Syaoran é na verdade um clone com metade do coração do primeiro Syaoran. Muitos anos atrás, Fei produziu o clone para reunir as penas de Sakura e o mágico que fez com que suas lembranças fossem perdidas por Sakura, Wang Reed, fez o primeiro prisioneiro Syaoran. Logo após a primeira quebra de Syaoran de Fei-Wang, seu coração é perdido pelo clone e se torna um fantoche que segue a vontade de Fei Wang, traindo o time. O primeiro Syaoran se junta a Sakura querendo salvar o clone na viagem do time. Prevendo outro em que Fai mata o primeiro Syaoran dirigido por Fei-Wang, o feitiço de, Sakura é esfaqueada em sua área, mas ao mesmo tempo divide a alma e seu corpo, entregando cada um a Seresu mundos distintos, bem como o Mundo dos Sonhos, respectivamente. No Dream World, a alma de Sakura é destruída pelo clone Syaoran ao tentar obter as penas. Antes de sua alma morrer, Sakura mostra que ela é um clone da primeira Sakura que também foi feita prisioneira por Fei Wang. Fei Wang subsequentemente exige que o corpo de Sakura utilize sua energia armazenada. A equipe parte para salvar os dois Sakuras do entendimento de Yuko de que Fei Wang está dentro de uma medida alternativa no Reino de Clow. Tal medição paralela é o efeito do desejo de Syaoran de conservar a primeira Sakura da ruína de Fei Wang anos atrás. Para permitir seu desejo, Syaoran tornou-se prisioneiro de Fei Wang e Kimihiro Watanuki, ajudante de Yuko, foi usado para substituir Syaoran em segundo plano em seu primeiro mundo.
A equipe combate Fei Wang, que destrói o clone de Syaoran quando ele o trai. Em seguida, ele usa o poder dos dois Sakuras e o poder incomensuravelmente poderoso para ressuscitar Yuko, acidentalmente congelada no tempo por Clow Reed sua partida para evitar, estabelecendo-se assim como Clow não inferior. Yuko utiliza a magia de Clow como pagamento e sua existência para ajudar a fazer os clones renascerem antes de viverem juntos. Como os 2 entendem que todos os eventos da string irão ocorrer, eles próprios são selados pelos clones antes do conflito contra ele na loja de Yuko. A equipe consegue destruir Fei Wang, que prende Syaoran em um vazio entre a área e o tempo, puxando Watanuki e seu clone como resultado do link. Usando a partida de seu criador, os dois clones de Syaoran e Sakura desaparecem, deixando duas penas. Watanuki e Syaoran escapam no vazio para obter um custo: Syaoran deve continuar enquanto Watanuki deve permanecer no estoque de Yuko, passando pelas medições eternamente. Onde Fai, Kurogane e Mokona escolhem se juntar a Syaoran mais uma vez na expectativa de conseguir um meio de restaurar os clones que permanecem como as duas penas, a equipe repousa no Reino de Clow. Antes de seguirem seus caminhos diferentes, Sakura e Syaoran admitem seu amor íntimo, mutuamente poderoso e puro um pelo outro, enquanto esperam se cumprir novamente.
